本週要處理的三個問題

1. 動物在研究設計中扮演什麼角色？
2. 研究條件如何限制結論的範圍？
3. 讀自己的 anchor paper 時，哪些結論有研究條件與資料支持，哪些需要保留？

今天的節奏

1. 建立判斷標準：分清實驗手段、推論角色與操作條件
2. 經典案例解析：實驗條件如何左右研究結論（DSS、環境菌相、田間試驗）
3. 掌握評估工具：釐清推論的限制與範圍、認識 EDA 工具與抓出論文漏洞
4. 實作演練：用自己的 Anchor paper，檢視研究條件並劃出合理推論範圍

本週核心概念

• 動物研究常見的三種誤解

從「該不該用」，到「代表了什麼」

先讓我們分清楚

先從研究問題定位動物的角色

動物模式的基本角色

動物模式是研究者選定的一組條件，用來觀察目標情境中某些可研究的機制或結果。

常見條件包括：

• 動物來源與遺傳背景：物種 (species)、品系 (strain)、特定建立的動物品系 (line) 或品種 (breed)
• 生理與疾病狀態：年齡、性別、體重、生理狀態與疾病階段
• 飼養與微生物背景：飼養條件、飲食、環境或是體內的微生物相
• 實驗處置程序：介入、攻毒或誘導、暴露與操作程序
• 指標與取樣時機：主要觀察指標與測量時間

DSS 小鼠腸炎：研究條件如何連到觀察結果？

條件高度受控，結果就一定一致嗎？

一項針對廣泛使用結腸炎模式的標竿研究

變異從何而來？微生物相本身就是模式條件

• 功能驗證：菌相移植後，受體小鼠呈現與供體來源一致的 DSS 疾病差異 (\(P = 0.0002\))；微生物相是重要的模式條件。

案例解析：實驗條件如何決定推論的邊界？

案例解析：大規模的豬場田間試驗

研究設計的取捨：實驗控制 vs. 現場真實性

評估推論範圍：四個判讀問題

評讀文獻或設計研究時，依序問：

看限制不是為了否定研究，而是看清它把問題往前推進了哪一步。

Experimental Design Assistant (EDA)：把研究條件畫出來

先定位你的 anchor paper

先從研究問題，釐清這篇論文的研究對象與結論範圍。

1. 研究直接關心的對象、族群或情境是什麼？
2. 研究中使用的動物或族群是什麼？
3. 作者希望把結果主要說到哪裡？

Anchor paper 練習｜動物研究條件盤點

請回到自己的 anchor paper，先找出：

1. 動物來源與遺傳背景：物種、品系、特定建立的動物品系或品種
2. 年齡、性別、體重、生理或疾病階段
3. 飼養與生物背景：飼養條件、飲食、微生物相、環境或田間條件
4. 研究處置：介入、攻毒或誘導、暴露與操作程序
5. 主要觀察指標與觀察期間

⚠️ 找不到的資訊更要記下來！
缺漏的條件，往往就是該研究推論邊界的盲點。

Anchor paper 練習｜結論範圍

用兩句話整理你的論文：

1. 本研究在……條件下，可以支持關於……的結論。
2. 本研究不能直接推論……，因為……。

理由可從這四項中選一項：

• 因為使用的動物是……
• 因為暴露條件是……
• 因為測量端點是……
• 因為研究情境是……

本週重點

1. 先辨認動物在研究中的角色：目標物種、動物模式，或兩者兼具。
2. 解讀研究限制時，要回到研究問題、動物條件與觀察端點。
3. 結論必須符合實際使用的條件與資料能支持的範圍。

下週前的閱讀準備

請帶著兩個問題閱讀：

1. 作者真正要回答的研究問題 是什麼？
2. 主要端點是否足以支持作者最後的結論？

下週會把大題目改寫成研究問題、研究目的、假說、主要端點與結論範圍。