A structured knowledge base for Nanopore sequencing, covering concepts, QC, alignment, taxonomy, and workflows.
這是一個給自己快速查閱用的 Nanopore 定序筆記網頁，目的在：
- 快速複習重要概念
- 幫助分析流程與工具選擇
- 保留之後延伸成教學材料與內部整理的空間
🚀 Quick access
Basic concepts
了解常見品質指標、read length 與核心名詞。
Sequencing QC
快速判讀 reads 數量、長度分布與整體品質。
Analysis tools
整理 alignment 與 taxonomy 分析工具的用途與差異。
Next topics
- Host depletion
- SAM / BAM / PAF
- Bracken
- Workflow overview
保留之後逐步補上的主題與延伸架構。
使用原則
每一頁盡量維持固定格式：
- 定義
- 為什麼重要
- 實務上怎麼看
- 常見誤解
- 常用工具 / 指令
Public vs private
- 🔓 Public：基本概念、工具介紹、一般分析原理
- 🔒 Private：workflow decision tree、內部 SOP、敏感比較表、參數門檻